Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms