Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms