Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms