Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ep400Q8CHI8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms