Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd4lQ8CFI0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nedd4lQ8CFI0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nedd4lQ8CFI0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd4lQ8CFI0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nedd4lQ8CFI0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd4lQ8CFI0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nedd4lQ8CFI0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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