Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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