Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh13Q8CEE7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh13Q8CEE7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh13Q8CEE7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh13Q8CEE7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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