Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms