Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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