Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms