Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntrobQ8CB62 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms