Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Atg4aQ8C9S8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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