Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtknQ8C6B2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtknQ8C6B2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms