Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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