Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms