Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms