Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ube3dQ8BX13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ube3dQ8BX13 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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