Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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