Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Als2cr12Q8BVM7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms