Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms