Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms