Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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