Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmem260Q8BMD6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms