Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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