Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms