Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms