Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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