Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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