Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms