Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q80Y73 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q80Y73 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q80Y73 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q80Y73 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q80Y73 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q80Y73 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q80Y73 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q80Y73 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q80Y73 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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