Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh8Q80Y20 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms