Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc116Q80X53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc116Q80X53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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