Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms