Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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