Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plxna4Q80UG2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plxna4Q80UG2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plxna4Q80UG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plxna4Q80UG2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plxna4Q80UG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms