Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp8Q80U87 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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