Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms