Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf516Q7TSH3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms