Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms