Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf2Q7TMI3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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