Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms