Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms