Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SynmQ70IV5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms