Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnih3Q6ZWS4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cnih3Q6ZWS4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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