Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp34Q6ZQ93 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp34Q6ZQ93 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp34Q6ZQ93 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms