Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms