Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms