Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trak1Q6PD31 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms