Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbtb40Q6PCS8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbtb40Q6PCS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms