Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa4Q6P8K8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa4Q6P8K8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms